En el torneo local el Club de Fútbol Monterrey clasifica como superlíder a la liguilla del Torneo Bicentenario 2010 tras empatar en la última jornada 1-1 con el Club Monarcas Morelia en el Estadio Morelos y así conseguir 36 unidades lo que representa su mejor cosecha de puntos en torneos cortos. El segundo título de su palmarés después de diecisiete años fue el campeonato del torneo Clausura 2003, de la mano del argentino Daniel Passarella como entrenador. La temporada 2002-2003 es la de mayor gloria para la sección: con un quinteto formado por Sarunas Jasikevicius, Juan Carlos Navarro, Dejan Bodiroga, Gregor Fucka y Roberto Dueñas, se consigue por fin la ansiada Euroliga contra la Benetton Treviso en el Palau Sant Jordi, título que se suma a la Liga y la Copa, consiguiendo de ese modo el triplete. Es uno de los equipos más grandes de Guatemala habiendo ganado 31 Ligas, 11 torneos de Copa, 5 Copas Campeón de Campeones, 2 Copas Fraternidad Centroamericana, 2 Copa Interclubes de la Uncaf y 1 Copa de Campeones de la Concacaf. Minutos sin apenas acercamientos de ninguno de los dos equipos.
El resultado al término de los 90 minutos del primer partido de la final fue a favor de los locales (Santos Laguna) por marcador de 3 goles contra 2 gracias a un error en la defensiva de los visitantes con un autogol del defensa veterano Duilio Davino. El rival en la final fue el Colo-Colo de Chile. Hasta sus últimos días, CDF emite todos los partidos correspondientes a la primera división de Chile más algunos de la Primera B de Chile. 8 de octubre de 2015 Santiago Chile 2:0 (0:0) Archivado el 26 de septiembre de 2015 en Wayback Machine. En el torneo Apertura 2006 llegaron a la liguilla, en el primer juego empataron 0:0 en el Estadio Tecnológico contra los Diablos Rojos del Toluca, pero en el de vuelta perdieron 2:1, con un gol de penal marcado por Sebastián «El Loco» Abreu, pero antes les habían anulado un gol de tiro libre ejecutado por Jesús «El Cabrito» Arellano. Además fue anunciada la contratación de Jesús Arellano, aquel jugador mundialista en Francia ’98 y que fue vendido a Chivas para combatir la crisis económica, volvía al equipo para ponerse a las órdenes de Floro y guiar a la ofensiva del plantel.
El entrenador ibérico se dio cuenta de que el Monterrey estaba en una crisis futbolística y que había muchísimo trabajo por realizar. Fue inminente la renuncia al cargo de entrenador por parte de Solari, por lo que llegó su auxiliar al timón, el recordado exjugador rayado Magdaleno Cano Ferro. Cano dirigió interinamente unos cuantos partidos antes de que la directiva anunciara la contratación del extécnico de Real Madrid, el español Benito Floro. El siguiente torneo, Verano 2000, venía como la oportunidad para Floro de demostrar su calidad como estratega. Luego de obtener su clasificación tras el campeonato obtenido en el Torneo Apertura 2009, Monterrey fue preclasificado directamente en la fase de grupos donde enfrentó al Deportivo Saprissa de Costa Rica, al Marathón de Honduras y al Seattle Sounders de Estados Unidos terminando la fase de grupos como líder de su sector después de 5 victorias y 1 empate. El 25 de marzo vence al Nacional en el Estadio Centenario de Montevideo por marcador de tres por dos en el último partido de la fase de grupos, con dos goles del brasileño Sinha (uno de penal), y otro más de Érick Hernández en tiempo de compensación convirtiéndose en el primer equipo mexicano en conseguir una victoria de visitante en esta competición.
